应用
灭火剂
全氟己酮在常温下是液体，由于其蒸发热仅仅是水的1/25，而蒸汽压是水的25倍，这些性质使它易于汽化并以气态存在，它主要依靠吸热达到灭火的效果。在保护环境方面，它是名副其实的绿色环保灭火剂。
由于全氟己酮的灭火浓度为4-6%，安全余量比较高，在使用时对人体更安全。全氟己酮常温下是液体，又不属于危险物品，可以在常压状态下安全地使用普通容器在较宽的温度范围内储存和运输（包括空运），而不像其它哈龙替代品那样需要压力容器储存、运输，但其沸点为48-49℃，作为灭火剂的用途仍有一定的局限，用于哈龙1211灭火器的替代，或用于B 类火防护的全淹没系统和局部应用系统。
清洗剂
全氟己酮可用作蒸汽反应器和蒸汽反应器部件的湿清洗剂，以及清洗气相反应器中积累的不需要沉积物、蚀刻气相反应器中的介电或金属材料以及在气相反应器中掺杂的各种材料。
实际应用中有各种液态化学制剂清洗，通常包括各种烃如丙酮或异丙酮，和各种含氟化学剂如全氟烃及全氟代氮化合物。水和烃不易解决含氟聚合物的残余物，此外水需要很长的干燥时间，而烃具有可燃性。而含氟化合物都是非常稳定的，并有可能促使全球变暖，且难以用气体洗涤器捕获或处理。全氟己酮则克服了以上传统清洗剂的缺点，清洗效果显著且对全球变暖趋势影响小。
溶剂
由全氟聚醚润滑剂可以作为涂层涂覆到基材如磁性媒质上，涂层干燥后，基材表面覆盖了一层薄而均匀的润滑膜。全氟己酮可以溶解各种全氟聚醚化合物。